ChEMBL-MCP-Server

基本能力

产品定位

ChEMBL-MCP-Server是一个提供对ChEMBL数据库API访问的服务器，主要用于化学和生物信息学领域的数据查询和处理。

核心功能

• 完整的ChEMBL数据库API访问
• 使用FastMCP框架实现的异步API调用
• 内置错误处理和超时机制
• 支持HTTP和stdio传输方法
• 完整的类型注释和文档字符串

适用场景

• 化学和生物信息学研究
• 药物发现和开发
• 化学数据分析和处理

工具列表

• example_activity: 获取活性数据
• example_assay: 获取测定数据
• example_target: 获取目标数据
• example_molecule: 获取分子数据
• example_drug: 获取药物数据
• example_canonicalizeSmiles: 规范化SMILES字符串
• example_smiles2inchi: 将SMILES转换为InChI
• example_smiles2svg: 将SMILES转换为SVG图像
• example_structuralAlerts: 获取结构警报

常见问题解答

• 如何启动服务器？使用python chembl_searver.py命令启动HTTP服务器。
• 如何指定主机和端口？使用--host和--port参数指定。
• 如何设置日志级别？使用--log-level参数设置。

使用教程

使用依赖

# 克隆仓库
git clone https://github.com/yourusername/ChEMBL-MCP-Server.git
cd ChEMBL-MCP-Server

# 安装依赖
pip install -r requirements.txt

安装教程

# 启动HTTP服务器（默认配置）
python chembl_searver.py

# 指定主机和端口
python chembl_searver.py --host 0.0.0.0 --port 8080

# 使用stdio传输
python chembl_searver.py --transport stdio

# 设置日志级别
python chembl_searver.py --log-level DEBUG

调试方式

• 使用--log-level DEBUG参数启动服务器以获取详细日志信息。
• 检查服务器日志以识别和解决问题。

许可证

该项目遵循 MIT 开源许可条款。