UniProt MCP Server
2024.12.27
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Python蛋白质信息服务生物信息学工具开发效率数据库
UniProt MCP Server 是一个基于 Model Context Protocol (MCP) 的服务，专门用于从 UniProt 获取蛋白质信息。该服务器允许 AI 助手直接获取蛋白质功能和序列信息。其主要功能包括通过 UniProt 编号获取蛋白质信息、批量检索多个蛋白质、24小时TTL缓存以提高性能、错误处理和日志记录等。
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Overview
基本能力
产品定位
UniProt MCP Server 是一个专门用于从 UniProt 获取蛋白质信息的服务，旨在为 AI 助手提供便捷的蛋白质数据访问能力。
核心功能
- 通过 UniProt 编号获取蛋白质信息
- 批量检索多个蛋白质
- 24小时TTL缓存以提高性能
- 错误处理和日志记录
- 提供的信息包括：
- 蛋白质名称
- 功能描述
- 完整序列
- 序列长度
- 生物体
适用场景
- 生物信息学研究
- 蛋白质功能分析
- 序列比对研究
- AI 辅助的生物数据分析
工具列表
get_protein_info- 获取单个蛋白质的信息
-
必需参数：
accession（UniProt 编号） -
get_batch_protein_info - 获取多个蛋白质的信息
- 必需参数：
accessions（UniProt 编号数组）
常见问题解答
- 如何处理无效的 UniProt 编号？服务器会返回404响应
- 如何处理API连接问题？服务器会处理网络错误并进行重试
- 如何处理速率限制？服务器会处理429响应
使用教程
使用依赖
- 确保已安装 Python 3.10 或更高版本
安装教程
- 克隆仓库：
bash git clone https://github.com/TakumiY235/uniprot-mcp-server.git cd uniprot-mcp-server - 安装依赖： ```bash # 使用 uv（推荐） uv pip install -r requirements.txt
# 或使用 pip pip install -r requirements.txt ```
调试方式
- 运行测试：
bash pytest - 检查代码风格：
bash black . isort . flake8 . mypy . bandit -r src/ safety check