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2025.03.18
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Python蛋白质结构处理生物信息学其它
mcp-rosetta 是一个用于处理蛋白质结构文件的工具，主要用于路径定义和环境变量设置，以便于后续的蛋白质结构处理和分析。
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Overview
基本能力
产品定位
mcp-rosetta 主要用于蛋白质结构文件的处理和分析，通过定义路径和环境变量来支持相关操作。
核心功能
- 定义脚本路径、PDB文件目录和输出目录。
- 设置 Rosetta 二进制文件和数据库的路径。
适用场景
- 蛋白质结构文件的处理和分析。
- 需要预先配置路径和环境变量的生物信息学工作流程。
使用教程
使用依赖
在使用 mcp-rosetta 之前，需要确保已安装 Rosetta 二进制文件和数据库，并设置好相应的环境变量。
安装教程
- 克隆或下载 mcp-rosetta 项目。
- 设置环境变量：
bash export ROSETTA_SCRIPT_PATH="/path/to/make_symmdef_file.pl" export PDB_DIR="/path/to/pdb_files" export OUTPUT_DIR="/path/to/pdb_output_files" export ROSETTA_BIN_PATH=/path/to/rosetta-binary/main/source/bin export ROSETTA_DB_PATH=/path/to/rosetta-binary/main/database
调试方式
安装完成后，可以通过检查环境变量是否正确设置来进行调试：
echo $ROSETTA_SCRIPT_PATH
echo $PDB_DIR
echo $OUTPUT_DIR
echo $ROSETTA_BIN_PATH
echo $ROSETTA_DB_PATH
许可证
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