UniProt MCP Server

基本能力

产品定位

UniProt MCP Server 是一个专门用于提供蛋白质信息的服务，主要面向需要获取和处理蛋白质数据的AI助手和开发者。

核心功能

• 通过UniProt accession number获取蛋白质信息
• 批量检索多个蛋白质信息
• 24小时TTL的缓存机制以提高性能
• 错误处理和日志记录
• 提供的信息包括：
• 蛋白质名称
• 功能描述
• 完整序列
• 序列长度
• 生物体来源

适用场景

• AI助手需要查询蛋白质信息时
• 开发者需要批量获取蛋白质数据进行研究
• 需要快速访问和比较不同蛋白质信息的场景

工具列表

1. get_protein_info
2. 获取单个蛋白质的信息

3. 必需参数：accession（UniProt accession number）

4. get_batch_protein_info

5. 获取多个蛋白质的信息
6. 必需参数：accessions（UniProt accession numbers数组）

常见问题解答

• 如何处理无效的accession numbers？服务器会返回404响应
• 如何处理API连接问题？服务器会处理网络错误并重试
• 如何处理速率限制？服务器会处理429响应
• 如何处理格式错误的响应？服务器会处理JSON解析错误

使用教程

使用依赖

• Python 3.10或更高版本

安装教程

1. 克隆仓库： bash git clone https://github.com/TakumiY235/uniprot-mcp-server.git cd uniprot-mcp-server
2. 安装依赖： ```bash # 使用uv（推荐） uv pip install -r requirements.txt

# 或使用pip pip install -r requirements.txt ```

调试方式

1. 设置开发环境： bash python -m venv .venv source .venv/bin/activate # Windows: .venv\Scripts\activate pip install -e ".[dev]"
2. 运行测试： bash pytest
3. 运行所有代码检查： bash black . isort . flake8 . mypy . bandit -r src/ safety check

许可证

该项目遵循 MIT 开源许可条款，请参阅 MIT 了解完整条款。