PubMed Enhanced Search MCP Server
2025.03.22
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Python学术搜索医学研究数据分析搜索工具开发效率
PubMed Enhanced Search MCP Server 是一个基于模型内容协议（MCP）的服务器，专门用于增强PubMed数据库的搜索和检索功能。它提供了多种高级搜索工具，包括关键词搜索、MeSH术语查找、出版物数量统计以及基于PICO的证据搜索等功能，旨在帮助研究人员更高效地获取和分析学术论文。
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Overview
基本能力
产品定位
PubMed Enhanced Search MCP Server 是一个专为研究人员和学术工作者设计的工具，旨在提供更高效、更精准的PubMed学术论文搜索和检索功能。
核心功能
- 关键词搜索：支持通过关键词搜索PubMed文章，并可选择期刊过滤。
- 排序功能：支持按相关性或日期（最新/最早）排序搜索结果。
- MeSH术语查找：查找与搜索词相关的医学主题词（MeSH）。
- 出版物数量统计：获取多个搜索词的出版物数量，用于比较流行度。
- 详细论文信息：检索包括摘要、DOI、作者和关键词在内的详细论文信息。
- PICO搜索：执行基于PICO（人群、干预、比较、结果）的结构化搜索，支持同义词和组合查询。
适用场景
- 学术研究：快速查找相关学术论文。
- 医学研究：通过MeSH术语和PICO搜索精准定位相关研究。
- 数据分析：统计和分析特定主题的出版物数量。
工具列表
search_pubmed- 关键词搜索PubMed文章。get_mesh_terms- 查找MeSH术语。get_pubmed_count- 获取出版物数量统计。format_paper_details- 获取详细论文信息。pico_search- 执行PICO搜索。
常见问题解答
- 速率限制：服务器实现了自动重试机制和退避延迟，以处理NCBI E-utilities服务的速率限制。
使用教程
使用依赖
- Python 3.6+
- pip
安装教程
- 克隆仓库：
git clone https://github.com/leescot/pubmed-mcp-smithery cd pubmed-mcp-smithery - 安装依赖：
pip install fastmcp requests
调试方式
- 启动服务器：
python pubmed_enhanced_mcp_server.py -
开发模式（自动重载）：
mcp dev pubmed_enhanced_mcp_server.py -
添加到Claude Desktop： 编辑配置文件
_CLAUDE_DIRECTORY/claude_desktop_config.json，添加服务器配置。