pubmed_search MCP server
2024.12.12
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Python文献搜索笔记管理其它
pubmed_search 是一个基于 MCP 协议的 PubMed 文献搜索服务。它提供了一个简单的笔记存储系统，支持自定义的 note:// URI 方案来访问单个笔记。每个笔记资源包含名称、描述和文本/纯文本 MIME 类型。该服务还提供了一个提示功能，可以总结所有存储的笔记，并允许通过 'style' 参数控制摘要的详细程度（简要/详细）。此外，服务还实现了一个工具，用于添加新笔记到服务器。
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Overview
基本能力
产品定位
pubmed_search 是一个基于 MCP 协议的 PubMed 文献搜索服务，主要用于文献检索和笔记管理。
核心功能
- 实现了一个简单的笔记存储系统
- 支持自定义 note:// URI 方案访问单个笔记
- 每个笔记资源包含名称、描述和文本/纯文本 MIME 类型
- 提供提示功能
- summarize-notes: 创建所有存储笔记的摘要
- 可选 "style" 参数控制详细程度（brief/detailed）
- 实现工具
- add-note: 添加新笔记到服务器
- 需要 "name" 和 "content" 作为必需字符串参数
- 更新服务器状态并通知客户端资源变更
适用场景
- 学术研究人员快速检索 PubMed 文献
- 文献阅读时进行笔记记录和管理
- 需要汇总多个文献笔记的场景
工具列表
- add-note: 添加新笔记到服务器
- 能力: 接受名称和内容作为输入，更新服务器状态并通知客户端
常见问题解答
- 调试困难: 由于 MCP 服务器通过 stdio 运行，调试可能具有挑战性
- 推荐使用 MCP Inspector 进行调试
使用教程
使用依赖
- 需要安装 Claude Desktop
- MacOS:
~/Library/Application\ Support/Claude/claude_desktop_config.json - Windows:
%APPDATA%/Claude/claude_desktop_config.json
安装教程
- 开发/未发布服务器配置:
"mcpServers": {
"pubmed_search": {
"command": "uv",
"args": [
"--directory",
"/Users/nofuture/Documents/GitHub/pubmed_search",
"run",
"pubmed_search"
]
}
}
- 已发布服务器配置:
"mcpServers": {
"pubmed_search": {
"command": "uvx",
"args": [
"pubmed_search"
]
}
}
调试方式
- 使用 MCP Inspector 进行调试:
npx @modelcontextprotocol/inspector uv --directory /Users/nofuture/Documents/GitHub/pubmed_search run pubmed-search
- 构建和发布:
uv sync
uv build
uv publish
- 需要设置 PyPI 凭据:
- Token:
--token或UV_PUBLISH_TOKEN - 或用户名/密码:
--username/UV_PUBLISH_USERNAME和--password/UV_PUBLISH_PASSWORD
- Token: